Le Fonds Spécial en faveur de l’Environnement (FSE) est créé en 1998 par la Loi n° 014/PR/98 du 17 Août 1998, définissant les principes généraux de la protection de l’environnement. C’est un instrument financier que le Gouvernement de la République du Tchad a mis en place pour faire face aux problèmes récurrents de dégradation de l’environnement et surtout de l’avancée galopante du désert. Il est devenu opérationnel en 2012 suite au décret  n° 168/PR/PM/MERH/2012, fixant ses modalités d’organisation et de fonctionnement.

L’objectif principal recherché est la mise en valeur de l’environnement, la préservation et la restauration de l’environnement dégradé ainsi que la gestion des ressources naturelles. A cette fin, sa mission consiste à rechercher les financements au niveau national et international pour financer les projets d’études, de recherche, de formation et toute autre action en faveur de la préservation de l’environnement et de la gestion des ressources naturelles.